沉磅颁布 | Xenium单细胞分辨率赋能肿瘤空间组学钻研
Xenium单细胞分辨率
赋能肿瘤空间组学钻研
CA88（以下简称“CA88医学”）秉承科研创新和敢于争先的心灵 ，与10x Genomics公司合作成立了高水平示范尝试室 ，配置了先进的科研设备 ，为临床科研提供单细胞转录组测序、空间转录组测序（Visium平台）和基于原位杂交技术的空间转录组（Xenium平台）检测服务 。
2024年1月16日 ，Xenium技术平台第一批尝试样本检测数据正式下机 ，质控齐全合格 ，在上海率先高质量高效能实现交付检测和数据分析 。该项目基于钻研者对“肿瘤-分子病理-单细胞/亚细胞分辨率空间组学”层层递进的钻研构思 ，确定各种类型细胞的空间定位、比例和散布特点 ，逐步将target bio-marker定位在单细胞 ，为佐证钻研者的idea提供了高水准、信息化和可视化的了局与证据 。
图1：肿瘤病理标注
图2：Xenium数据概览
图3：Xenium将光学特点解码为转录本表白 ，采集并形成图像
图4-1：利用DAPI对细胞核染色 ，结合深度进建步骤揣度齐全的细胞天堑
图4-2：利用DAPI对细胞核染色 ，结合深度进建步骤揣度齐全的细胞天堑
图5：将转录本分配给细胞
图6-1：实现单细胞/亚细胞分辨率的空间转录组分析 ，绿点-EPCAM , 蓝点-KLRD1 ，粉红点-LILRB2
图6-2：实现单细胞/亚细胞分辨率的空间转录组分析 ，绿点-EPCAM转录本
Xenium 具备单一急剧的工作流程
CA88医学单细胞转录组测序
与空间组学技术平台
目前 ，CA88医学单细胞转录组测序与空间组学三大平台已承接多个三级医院临床与科研专家的项目 ，服务涉及北京、上海、广东和江西等多个区域 。CA88医学将持续结合肿瘤专家、分子病理专家、生信专家/团队和厂商专家 ，凝心聚力为客户提供高质量、高效能和可信任的科研服务 。
